Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
RxraP28700 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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RxraP28700 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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RxraP28700 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
RxraP28700 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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