Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 AC162934.2-201ENSMUST00000221451 249 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr559-201ENSMUST00000084816 1022 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Txnip-202ENSMUST00000074519 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 AC093043.2-201ENSMUST00000228616 2017 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr1509-202ENSMUST00000205900 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm37920-201ENSMUST00000192952 749 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Pik3cg-205ENSMUST00000217915 3340 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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