Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TtrP07309 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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TtrP07309 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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TtrP07309 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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TtrP07309 Wars2-205ENSMUST00000198044 403 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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TtrP07309 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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TtrP07309 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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TtrP07309 CT033781.3-201ENSMUST00000221886 504 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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TtrP07309 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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TtrP07309 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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TtrP07309 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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TtrP07309 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TtrP07309 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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TtrP07309 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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TtrP07309 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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TtrP07309 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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TtrP07309 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TtrP07309 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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