Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usf3B2RUQ2 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms