Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Khdc3Q9CWU5 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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