Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim12aQ99PQ1 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms