Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 B3galt5-202ENSMUST00000113800 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Adgrl2-204ENSMUST00000195988 4541 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Plagl2-202ENSMUST00000109795 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Rnf17Q99MV7 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Rnf17Q99MV7 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Rnf17Q99MV7 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Rnf17Q99MV7 Rbm12-202ENSMUST00000109604 6635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Rnf17Q99MV7 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Rnf17Q99MV7 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Rnf17Q99MV7 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Rnf17Q99MV7 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Rnf17Q99MV7 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
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Rnf17Q99MV7 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf17Q99MV7 Slc5a6-201ENSMUST00000080431 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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