Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71Q8VEG0 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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