Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm28361-201ENSMUST00000188825 474 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Ly6a-205ENSMUST00000189068 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm4873-201ENSMUST00000199402 1203 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm45255-201ENSMUST00000209943 811 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm45549-201ENSMUST00000210180 975 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Tmem156-205ENSMUST00000212194 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 AC162176.1-201ENSMUST00000216490 618 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Fabp5l2-201ENSMUST00000072582 408 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Hip1-201ENSMUST00000060311 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 4930503E24Rik-201ENSMUST00000219167 1333 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo9-201ENSMUST00000001402 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Mical2-201ENSMUST00000037991 3352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Pclaf-201ENSMUST00000045802 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Ssuh2Q8C3L1 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Klf10-201ENSMUST00000074043 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Igkv2-112-202ENSMUST00000103319 358 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm14561-201ENSMUST00000117376 798 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm15286-201ENSMUST00000150623 743 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Tle6-213ENSMUST00000151858 627 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ssuh2Q8C3L1 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms