Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinb9c-201ENSMUST00000021837 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Slc30a6-201ENSMUST00000024870 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Spdye4b-201ENSMUST00000031574 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4877-201ENSMUST00000104977 798 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12210-201ENSMUST00000118245 153 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Polr1e-204ENSMUST00000133157 2986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Sfta2-202ENSMUST00000174521 649 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm379-201ENSMUST00000178160 888 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6356-201ENSMUST00000183541 102 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinc1-202ENSMUST00000191936 725 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43647-201ENSMUST00000198142 486 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 4933416O17Rik-201ENSMUST00000220972 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Bdh2-201ENSMUST00000029817 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufa4-201ENSMUST00000031637 468 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2447-202ENSMUST00000193813 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Pes1-202ENSMUST00000109985 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Pes1-201ENSMUST00000020705 2911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17473-202ENSMUST00000228544 2071 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpn20-201ENSMUST00000022508 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 B3gat1-205ENSMUST00000161115 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Sorbs1-221ENSMUST00000225786 2314 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44998-201ENSMUST00000207091 1768 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Irx6-202ENSMUST00000167261 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Fas-201ENSMUST00000025691 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Sox2ot-210ENSMUST00000197697 2533 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Lipc-204ENSMUST00000216798 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42515-201ENSMUST00000199936 3583 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Glul-201ENSMUST00000086199 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ovch2-201ENSMUST00000106755 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo11-201ENSMUST00000005504 4019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 AC159886.2-201ENSMUST00000214737 2740 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 AC154377.1-201ENSMUST00000226752 4979 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh15-241ENSMUST00000195531 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ptk2-209ENSMUST00000226988 4444 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 AC122829.1-201ENSMUST00000219743 1631 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43839-201ENSMUST00000196183 2325 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Utp14a-201ENSMUST00000080713 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Timeless-206ENSMUST00000105245 4402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ace2-201ENSMUST00000073973 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Nrf1-205ENSMUST00000115200 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gramd1b-203ENSMUST00000119373 3857 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7331-201ENSMUST00000118642 387 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Recql5os1-201ENSMUST00000134391 396 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Uba52-208ENSMUST00000165126 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8540-201ENSMUST00000168952 732 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27406-201ENSMUST00000184881 182 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29739-201ENSMUST00000191760 529 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 1700104L18Rik-201ENSMUST00000220132 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Loxhd1-201ENSMUST00000035501 3814 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gtpbp6Q3U6U5 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms