Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ctdnep1Q3TP92 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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