Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
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Cntn3Q07409 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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Cntn3Q07409 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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Cntn3Q07409 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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Cntn3Q07409 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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Cntn3Q07409 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cntn3Q07409 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Cntn3Q07409 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
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