Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Sh3bp1P55194 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms