Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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