Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprkP35822 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Fmn1-203ENSMUST00000102547 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Arhgap21-213ENSMUST00000173194 6920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm37233-201ENSMUST00000192173 6263 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Dclk1-207ENSMUST00000198412 4282 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtprkP35822 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprkP35822 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms