Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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Hoxd10P28359 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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Hoxd10P28359 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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Hoxd10P28359 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Hoxd10P28359 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Hoxd10P28359 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Hoxd10P28359 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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Hoxd10P28359 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Hoxd10P28359 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Hoxd10P28359 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Hoxd10P28359 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Hoxd10P28359 Vezt-203ENSMUST00000118205 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Hoxd10P28359 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Hoxd10P28359 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd10P28359 Muc6-203ENSMUST00000190907 8757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms