Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Zdhhc22-202ENSMUST00000222543 3462 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 B020014A21Rik-201ENSMUST00000217333 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Plch1-208ENSMUST00000160638 6271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sptan1P16546 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms