Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 AC167013.3-201ENSMUST00000228110 989 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC101831.1-201ENSMUST00000228245 691 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC171241.2-201ENSMUST00000228744 892 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Bdh2-201ENSMUST00000029817 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gng2-201ENSMUST00000055100 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm8623-201ENSMUST00000071573 436 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 6330409D20Rik-201ENSMUST00000009695 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Pramef6-201ENSMUST00000081645 1487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Tex24-201ENSMUST00000095375 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Slitrk2-201ENSMUST00000036043 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Hist1h4f-201ENSMUST00000102971 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Hist1h4h-201ENSMUST00000102972 470 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm26012-201ENSMUST00000104411 128 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr639-201ENSMUST00000106862 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Rhox4d-201ENSMUST00000115175 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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Trim39Q9ESN2 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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Trim39Q9ESN2 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Fam187b-202ENSMUST00000128384 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm14061-201ENSMUST00000155923 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm17138-201ENSMUST00000165702 459 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm18353-201ENSMUST00000185906 784 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 2310005E17Rik-201ENSMUST00000186644 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Pdlim5-209ENSMUST00000196908 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm19148-201ENSMUST00000197045 429 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm43934-201ENSMUST00000205095 388 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC142407.1-201ENSMUST00000214371 494 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Thy1-204ENSMUST00000214627 446 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm5654-201ENSMUST00000217787 475 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC153500.1-201ENSMUST00000219794 625 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC132384.1-201ENSMUST00000219908 1195 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC167019.4-201ENSMUST00000226494 1070 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 AC160930.2-201ENSMUST00000226608 303 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Ly6f-201ENSMUST00000023247 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Guca2a-201ENSMUST00000024015 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Gm8394-201ENSMUST00000079684 952 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Trim39Q9ESN2 Olfr1418-201ENSMUST00000079875 1072 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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