Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rnft1Q9DCN7 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms