Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp27Q8CEG8 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms