Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc88cQ6VGS5 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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