Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp49Q6P9L4 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms