Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Oprl1-202ENSMUST00000108763 2971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 AC113304.1-201ENSMUST00000214014 1833 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm13573-201ENSMUST00000116410 631 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Rubie-201ENSMUST00000151828 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm24838-201ENSMUST00000158684 130 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm43709-201ENSMUST00000199870 559 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Spa17-201ENSMUST00000002013 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm14267-208ENSMUST00000228324 1189 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 AC122877.1-201ENSMUST00000228873 218 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm26244-201ENSMUST00000083435 164 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Wdcp-206ENSMUST00000223551 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef7-202ENSMUST00000074856 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Mitf-203ENSMUST00000101123 2144 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Mitf-204ENSMUST00000113339 2144 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 2610008E11Rik-201ENSMUST00000039271 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Stil-201ENSMUST00000030490 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Abca8a-201ENSMUST00000046223 5614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Acsl6-206ENSMUST00000101211 3106 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Arfgef2-201ENSMUST00000099078 8770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 AW822252-205ENSMUST00000192662 1352 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Adgrl3-209ENSMUST00000119385 4905 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Cyp4a29-201ENSMUST00000118278 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Phc3-202ENSMUST00000064718 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Cfap65-201ENSMUST00000094844 5727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Dusp27-201ENSMUST00000085992 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Slc18b1-201ENSMUST00000119597 2837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm12430-201ENSMUST00000121539 1322 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 CT009546.2-201ENSMUST00000223012 3476 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Rprd1b-201ENSMUST00000029180 4283 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Il12b-202ENSMUST00000170513 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm12838-201ENSMUST00000116278 325 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm12180-201ENSMUST00000120905 661 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm1947-201ENSMUST00000122451 910 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 1700029J03Rik-202ENSMUST00000189879 712 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrrc43Q3V0L5 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms