Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Trim71Q1PSW8 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Trim71Q1PSW8 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms