Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Kif26b-202ENSMUST00000161017 13749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm13490-201ENSMUST00000143870 2409 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.2 ms