Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irx1P81068 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irx1P81068 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Irx1P81068 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms