Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd13P70217 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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