Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NcanP55066 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Pcdh9-201ENSMUST00000068992 3714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC113031.6-202ENSMUST00000228468 1145 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Zdhhc22-202ENSMUST00000222543 3462 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Tgfb3-201ENSMUST00000003687 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm38661-201ENSMUST00000216555 5814 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
NcanP55066 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
NcanP55066 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
NcanP55066 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
NcanP55066 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
NcanP55066 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
NcanP55066 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
NcanP55066 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
NcanP55066 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NcanP55066 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NcanP55066 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NcanP55066 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
NcanP55066 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NcanP55066 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NcanP55066 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NcanP55066 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
NcanP55066 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
NcanP55066 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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