Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp4P35123 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms