Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Zfp871-202ENSMUST00000159086 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Nckap1l-201ENSMUST00000047405 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Olfr557-202ENSMUST00000215423 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Nedd4l-204ENSMUST00000224347 3150 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Vmn1r40-202ENSMUST00000226925 3011 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Hip1-201ENSMUST00000060311 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Olfr1276-203ENSMUST00000218065 5052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
PtprmP28828 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms