Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Hoxd10P28359 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms