Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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Ccl20O89093 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Ccl20O89093 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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