Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Ssxa1B1AUS7 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Ssxa1B1AUS7 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Ssxa1B1AUS7 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Ssxa1B1AUS7 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Ssxa1B1AUS7 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Ssxa1B1AUS7 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Ssxa1B1AUS7 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Ssxa1B1AUS7 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Ssxa1B1AUS7 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Ssxa1B1AUS7 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ssxa1B1AUS7 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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