Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Cep83os-201ENSMUST00000181906 6566 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Tenm4-201ENSMUST00000107162 11021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 2900026A02Rik-202ENSMUST00000211733 10238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Wdr11-201ENSMUST00000084519 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Lepr-201ENSMUST00000037552 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Add2-209ENSMUST00000204059 8182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Col5a3Q9JLI2 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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