Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Ebf1-201ENSMUST00000081265 5981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Epas1-201ENSMUST00000024954 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Brip1os-201ENSMUST00000128960 4423 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Slco2b1-201ENSMUST00000032985 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Etohd2-201ENSMUST00000162450 4862 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Tma16-201ENSMUST00000026681 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CubnQ9JLB4 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms