Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NubplQ9CWD8 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
NubplQ9CWD8 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NubplQ9CWD8 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NubplQ9CWD8 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
NubplQ9CWD8 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
NubplQ9CWD8 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms