Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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PtprtQ99M80 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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PtprtQ99M80 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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PtprtQ99M80 Casp14-202ENSMUST00000219237 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
PtprtQ99M80 Kcna2-201ENSMUST00000038695 11582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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PtprtQ99M80 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprtQ99M80 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms