Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Abca17-201ENSMUST00000039324 5202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm27048-201ENSMUST00000182891 4627 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NipblQ6KCD5 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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