Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PcolceQ61398 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms