Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
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Ctdnep1Q3TP92 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Ctdnep1Q3TP92 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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Ctdnep1Q3TP92 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Ctdnep1Q3TP92 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ctdnep1Q3TP92 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms