Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Retreg1-203ENSMUST00000226438 2783 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ttc21bQ0HA38 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ttc21bQ0HA38 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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