Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Pkp1P97350 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Pkp1P97350 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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