Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms