Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rpl28P41105 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm13742-201ENSMUST00000118805 457 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm15401-201ENSMUST00000081929 1107 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rpl28P41105 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms