Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pabpc1P29341 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms