Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm6798-201ENSMUST00000119961 360 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm14528-201ENSMUST00000120615 231 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm30270-201ENSMUST00000202675 524 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm45408-201ENSMUST00000211080 390 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Spef2-205ENSMUST00000162780 1639 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Zfp791-201ENSMUST00000098550 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Rgs9-203ENSMUST00000106704 3464 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 A630001G21Rik-201ENSMUST00000064788 1353 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm38251-201ENSMUST00000192968 2575 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Asb17-201ENSMUST00000044089 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm13750-201ENSMUST00000117621 465 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm12864-201ENSMUST00000122207 1006 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Pitpnm2os2-202ENSMUST00000162577 744 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd9P28357 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms