Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Mrpl48-201ENSMUST00000064334 1865 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Vezt-203ENSMUST00000118205 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sptan1P16546 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms