Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Fxyd5-207ENSMUST00000161684 1172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Ccl20O89093 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccl20O89093 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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