Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 AC162176.1-201ENSMUST00000216490 618 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm36952-201ENSMUST00000194923 3625 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Phc3-203ENSMUST00000099163 2808 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm28864-201ENSMUST00000189251 644 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Gm2035J3QP87 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms