Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprbB2RU80 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms